近日,九江市農(nóng)業(yè)科學(xué)院攜手中山大學(xué)及江西省瑞昌長(zhǎng)江四大家魚(yú)原種場(chǎng),共同取得了一項(xiàng)重要的科研成果:成功組裝并發(fā)布了長(zhǎng)江流域極危物種“鳤”的高質(zhì)量染色體水平基因組。這一成果標(biāo)志著我國(guó)在淡水魚(yú)類(lèi)遺傳資源保護(hù)方面邁出了關(guān)鍵一步。
鳤,這一曾廣泛分布于長(zhǎng)江流域的重要淡水經(jīng)濟(jì)魚(yú)類(lèi),因環(huán)境惡化和人類(lèi)活動(dòng)的影響,數(shù)量急劇減少,已瀕臨滅絕。在《中國(guó)脊椎動(dòng)物紅色名錄》和《中國(guó)生物多樣性紅色名錄 — 脊椎動(dòng)物卷》中,鳤均被列為極危物種,其保護(hù)工作刻不容緩。2020年12月,在長(zhǎng)江公安江段監(jiān)測(cè)到的7尾鳤,成為近年來(lái)野外調(diào)查發(fā)現(xiàn)的最大數(shù)量,這一發(fā)現(xiàn)更加凸顯了保護(hù)鳤的緊迫性。
然而,鳤基因組信息的缺乏一直是保護(hù)工作的一大難題。為了破解這一難題,研究團(tuán)隊(duì)利用先進(jìn)的PacBio和Hi-C測(cè)序技術(shù),成功組裝了鳤染色體級(jí)別的基因組。該基因組大小為883.1 Mb,包含24條假染色體,Scaffold N50長(zhǎng)度為35.1 Mb。研究團(tuán)隊(duì)還結(jié)合轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù),預(yù)測(cè)了28674個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因,為深入了解鳤的遺傳特性和制定有效保護(hù)策略提供了重要依據(jù)。
研究團(tuán)隊(duì)已將組裝和注釋的基因組數(shù)據(jù)公布到GenBank和Figshare數(shù)據(jù)庫(kù),供全球科研人員共享和使用。這一舉措不僅有助于推動(dòng)鳤保護(hù)工作的深入開(kāi)展,還將為其他瀕危物種的保護(hù)提供有益的借鑒和參考。
論文的共同通訊作者盧建國(guó)強(qiáng)調(diào):“鳤基因組信息的首次發(fā)布,對(duì)于理解其遺傳多樣性、識(shí)別獨(dú)特適應(yīng)性以及制定更加精準(zhǔn)有效的保護(hù)策略具有至關(guān)重要的意義。我們期待這一成果能夠?yàn)轼A的保護(hù)工作帶來(lái)新的突破和進(jìn)展?!?/p>
隨著科技的不斷進(jìn)步和科研人員的持續(xù)努力,相信鳤等瀕危物種的保護(hù)工作將取得更加顯著的成效。同時(shí),我們也呼吁社會(huì)各界共同關(guān)注和支持瀕危物種保護(hù)工作,為保護(hù)地球生物多樣性貢獻(xiàn)自己的力量。